違います。
スーパーでよく見かけるのはメバチ・キハダマグロで、サッパリとした味わいです。
本マグロ（赤身）は、濃く深みがある味わいが特徴です。

トロはメバチは筋が多め、キハダほぼ赤身でトロは取れません。
本マグロ・ミナミマグロのトロは綺麗なサシが入っていて、口の中で脂がとけます。

違います。
マグロは回遊魚で、天然ものは大海原を元気に泳ぎ回っています。その分、身も締まっていてギュッと凝縮された味わいをお楽しみいただけます。
畜養（養殖）は、限られた養殖場内を泳いでいるので、天然に比べて味がぼやけている印象です。
最近は、畜養（養殖）技術向上により、ブランド化されたグレードが高いものもありますので、天然と養殖を食べ比べてみるのも面白いと思います。

国内の流通量が少なく、一般的なスーパーでは取扱いがほぼありません。
水産庁の資料によると、国内のマグロ供給量(2018年）は36.5万トン。うち、
・本マグロ（クロマグロ）5.1トン（14％）
・ミナミマグロ1.7トン(4.7%）
ですが、その殆どが畜養(養殖）です。
天然ものは、
・本マグロ：およそ1トン(3%）
・ミナミマグロ：0.8トン（2.2％）
と供給量が少なく、その殆どが寿司屋や料理店に卸されます。
当店ではその希少な天然ものをお取り扱いしております。

どちらも美味しく召し上がれます。
[冷凍or生]の違いより、[マグロの種類]・[天然or養殖]の違いで大きく味が違います。
当店では冷凍ものをご販売していますが、漁獲後直ちに活〆され、船上で超低温（-50℃以下）で冷凍したマグロですので、漁獲直後の鮮度が保たれています。